
▍01 關于 ProtiFi
ProtiFi 是一家致力于將組學技術推向臨床應用轉化階段的生物科技公司,長期專注于組學樣品制備和處理技術的研究。組學作為一類對生物分子群體進行整體分析的科學手段,涵蓋基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、糖組學、代謝組學及脂質組學等重要方向;ProtiFi 圍繞這些方向,開發了一系列用于樣品收集、制備、流程控制、色譜分析以及數據解析的工具和系統。
在蛋白質組學研究中,樣品制備環節往往是導致整體數據變異的關鍵因素之一。由于蛋白質本身具有多樣的溶解特性,且其在收集、存儲與處理過程中可能持續發生變化,傳統樣品處理方法常常面臨重復性不足的困擾。ProtiFi 針對這一行業共性難題,構建了以 S-Trap 為核心的技術矩陣,并逐步拓展至多組學樣品同步處理、蛋白酶開發以及數據可視化等多個維度,形成了覆蓋"樣品制備—酶解—數據分析"的完整解決方案。
ProtiFi 的產品已被應用于研究機構和制藥企業的日常實驗中。數以千計的研究文獻引用了 ProtiFi 的樣品制備技術,體現出其在組學領域的應用廣度。
▍02 核心優勢
? 通用型樣品制備流程
ProtiFi 的 S-Trap 技術采用強變性條件處理樣品,提供了一套可通用于各類樣品的制備方案。無論是骨組織中的高疏水性蛋白,還是血液中的水溶性蛋白,均可使用同一套流程進行處理,無需針對不同樣品類型反復摸索條件。
? 重復性與回收率表現穩定
S-Trap 技術在蛋白質鑒定數量、定量重復性方面均有良好表現。相關研究比較了溶液內酶解、FASP 以及 S-Trap 等多種酶解方法,結果表明 S-Trap 在蛋白質鑒定數量和定量重復性上均展現出穩定的性能。
? 兼容自動化平臺
S-Trap 96 孔板形式可兼容 Tecan A200 正壓工作站、安捷倫 Bravo 等多種自動化平臺,滿足高通量組學樣品制備需求。ProtiFi 與 Tecan 合作開發的自動化流程,進一步提升了樣品處理的規范程度。
? 單樣品多組學同步處理
Si-Trap 技術支持從單個樣品中同步獲取蛋白質、代謝物、脂質、核酸、糖鏈等多類生物分子的分析組分,為多組學研究提供了統一的樣品制備入口。
? 酶解時間顯著縮短
Tryp-N 作為一種熱穩定性酶,可在數分鐘至數小時內完成蛋白質酶解,替代傳統的過夜酶解步驟,縮短實驗周期。
▍03 熱門產品介紹
▍產品一:S-Trap 樣品制備產品
◎ 產品品名:S-Trap Micro Kit、S-Trap Micro Spin Columns、S-Trap 96-well Micro Plates、S-Trap Turbo 96-well Mini Plates
◎ 產品特點:S-Trap 樣品制備產品采用離心柱或 96 孔板形式供應,提供含預制緩沖液的全套試劑盒形式,兼顧操作便利性、最短準備時間與最高重復性。該技術使得在蛋白質組學樣品制備中使用 SDS 等強變性劑成為可能,并能去除鹽類、去污劑和緩沖液等污染物。其中,S-Trap Turbo 版本進一步縮短了蛋白質組學樣品制備的總處理時間;96 孔板版本兼容多種自動化平臺。
◎ 存儲條件:2-8℃ 保存。
◎ 工作原理:S-Trap 工作流程始于使用強去污劑對樣品進行裂解和溶解,繼以酸化至 pH 1 以進一步變性蛋白質并消除酶活性,隨后使用高濃度有機溶劑處理樣品,最后進行酶解反應。整套流程不依賴于樣品類型,可從骨組織、血液、腦組織的樣品中均可使用同一套流程進行處理。
◎ 使用方法:
1. 使用含強去污劑的裂解緩沖液對樣品進行裂解和蛋白溶解;
2. 將樣品酸化至 pH 1,進一步變性蛋白質;
3. 加入高濃度有機溶劑,將樣品加載至 S-Trap 離心柱或 96 孔板中;
4. 通過離心或正壓驅動,使蛋白質被困于 S-Trap 介質中,洗滌去除去污劑、鹽類等污染物;
5. 加入蛋白酶進行酶解;
6. 洗脫肽段,用于下游質譜分析。
▍產品二:Si-Trap 多組學樣品制備產品
◎ 產品品名:Si-Trap
◎ 產品特點:Si-Trap 在 S-Trap 的基礎上進行了優化,專為多組學樣品制備而設計。它支持從單個樣品中產出多組學分析所需的多個組分。研究表明,使用 MCF7 乳腺癌細胞進行評測時,Si-Trap 在全局蛋白質組、磷酸化蛋白質組和酪氨酸磷酸化蛋白質組分析中識別的蛋白質數量均較尿素法更多;在代謝組學方面,正離子模式下 Si-Trap 檢測到 81 種代謝物,與標準工作流程持平,負離子模式下檢測到 83 種代謝物,接近標準方法的 85 種。這意味著 Si-Trap 在提供更強的蛋白質組學深度的同時,保留了較廣的代謝物檢測覆蓋度。
◎ 存儲條件:具體存儲條件請以產品隨附說明書為準。
◎ 工作原理:Si-Trap 建立在 S-Trap 技術的高效性基礎上,通過對單個樣品進行同步處理,分離并捕獲蛋白質、代謝物、脂質、核酸、糖鏈等多類生物分子,使研究人員可以從一次樣品制備中獲得多組學分析所需的多個組分。
◎ 使用方法:
1. 使用 Si-Trap 專用流程對單個生物樣品進行同步處理;
2. 按照流程依次獲取蛋白質、代謝物、脂質等組分;
3. 各組分分別進入對應的下游分析流程(如質譜分析等);
4. 整合多組學數據,獲得更全面的生物學見解。
▍產品三:Tryp-N 蛋白酶
◎ 產品品名:Tryp-N
◎ 產品特點:Tryp-N 是一種經過工程化改造的熱穩定性金屬蛋白酶,可對精氨酸和賴氨酸的 N 端進行特異性切割。在單克隆抗體肽圖分析中,Tryp-N 表現出與胰蛋白酶相當或更優的序列覆蓋率,并提供互補的片段化模式——胰蛋白酶肽段通常具有強烈的 y 離子系列,而 Tryp-N 則產生強烈的 b 離子,這種正交性在確定修飾位點(如脫酰胺、氧化或單氨基酸變異)時尤為有用。研究顯示,對于曲妥珠單抗,Tryp-N 實現了重鏈和輕鏈 100% 的序列覆蓋率;與胰蛋白酶相比,Tryp-N 生成的肽段-譜圖匹配數量有所增加(曲妥珠單抗增加 59%、NISTmAb 增加 35%、西妥昔單抗增加 8%、貝伐珠單抗增加 7%)。
◎ 存儲條件:具體存儲條件請以產品隨附說明書為準。
◎ 工作原理:Tryp-N 作為一種熱嗜性酶,在數分鐘至數小時的時間內即可完成蛋白質消化,而不再需要傳統的過夜酶解。它與胰蛋白酶均在 K/R 位點切割,但切割方向相對,從而產生互補的片段化模式,為質譜分析提供正交的證據支持。
◎ 使用方法:
1. 將待酶解的蛋白樣品制備好后,加入 Tryp-N 蛋白酶;
2. 在適宜溫度下孵育數分鐘至數小時;
3. 酶解完成后,獲取肽段用于 LC-MS 分析;
4. 如需進一步提高序列覆蓋率或修飾位點定位的可信度,可將 Tryp-N 與胰蛋白酶聯合使用。
▍04 解決的實驗問題
? 蛋白質溶解度差異導致的處理難題:蛋白質的溶解特性各異,傳統方法難以用流程處理不同類型的樣品。S-Trap 使用強去污劑可溶解各類樣品(包括整只小鼠心臟在內的組織),并用流程處理骨、血、腦等不同來源樣品,從而獲得一致的處理結果。
? 樣品制備變異性過大:據公開研究報道,樣品制備環節可能導致蛋白質組學中高達 75% 的整體變異性。ProtiFi 的解決方案將樣品制備的數據變異性降低至 10% 以下,提升了數據的可靠性。
? 去污劑干擾質譜分析:在制備哺乳動物細胞生物反應器上清液等樣品時,培養介質中常含有與質譜蛋白質組學不相容的聚合物表面活性劑(如 Pluronic F68),必須在樣品制備過程中清除。S-Trap 可大幅降低或消除此類聚合物,提供潔凈的樣品。
? 多組學研究的樣品分割困境:傳統多組學工作流需將樣品分割或順序切片,再分別進行處理,既繁瑣又可能引入偏差。Si-Trap 允許從單個樣品Workflow中獲取高質量的代謝組和蛋白質組組分,省去了樣品分割的麻煩。
? 酶解耗時過長:傳統胰蛋白酶酶解通常需要過夜。Tryp-N 將酶解時間縮短至數分鐘至數小時,加快了整個蛋白質組學分析的節奏,同時也提升了磷酸肽的回收率。
? 單克隆抗體肽圖分析的復雜性:在生物類似藥可比性、序列確認、多屬性方法工作流、翻譯后修飾定位以及低水平變異分析中,Tryp-N 可作為胰蛋白酶的"鏡像蛋白酶",提供互補的正交證據,有助于在譜圖復雜的情況下準確定位修飾位點。
▍05 購買疑問與解答
Q1:ProtiFi 產品通過什么渠道購買?
A:上海起發實驗試劑有限公司是 ProtiFi 的特約代理經銷商,可通過上海起發實驗試劑有限公司采購 ProtiFi 全系產品,包括 S-Trap 系列、Si-Trap、Tryp-N 以及 SimpliFi 數據可視化平臺的相關服務。
Q2:S-Trap 產品有哪些規格可選?
A:S-Trap 提供多種規格與形式,包括 S-Trap Micro Kit(適用于 ≤100 µg 樣品)、S-Trap Micro Spin Columns、S-Trap 96-well Micro Plates 以及 S-Trap Turbo 96-well Mini Plates,可滿足從常規科研到高通量自動化制備的不同需求。
Q3:S-Trap 產品如何保存?
A:S-Trap 通用蛋白質組學樣品制備試劑盒的保存條件為 2-8℃。其他產品的具體存儲條件請以產品隨附說明書為準。
Q4:S-Trap 是否兼容自動化設備?
A:S-Trap 96 孔板形式可兼容 Tecan A200 正壓工作站、安捷倫 Bravo 等多種自動化平臺。ProtiFi 與 Tecan 合作開發的自動化流程,可實現緊湊型臺式樣品制備,保證流程的重復性和一致性。
Q5:Tryp-N 與胰蛋白酶有何區別?
A:Tryp-N 和胰蛋白酶均在 K/R 位點切割,但切割方向相對——胰蛋白酶肽段通常具有強烈的 y 離子系列,而 Tryp-N 則產生強烈的 b 離子。這種互補的片段化模式在確定修飾位點(如脫酰胺、氧化或單氨基酸變異)時尤為有用,兩者聯合使用可進一步提高序列覆蓋率。
Q6:Si-Trap 是否真的能從單個樣品中獲取多組學數據?
A:是的。Si-Trap 支持從單個樣品Workflow中產出蛋白質、代謝物、脂質、核酸、糖鏈等多類生物分子的分析組分。評測數據顯示,Si-Trap 在提供更多蛋白質鑒定的同時,代謝物檢測覆蓋度與標準工作流程相當。
Q7:ProtiFi 產品是否可用于臨床診斷?
A:ProtiFi 產品用于科學研究,不可用于人體,不可用于診斷或治療。
Q8:SimpliFi 數據平臺如何使用?
A:SimpliFi 是一個瀏覽器可訪問的在線平臺,接受并整合來自任意方法的各類組學數據,將其提煉為干凈的交互式展示,并可一鍵導出。用戶無需深厚的組學背景即可探索并可視化數據,理解生物狀態并形成假設。
Q9:使用 S-Trap 是否需要改變現有的裂解緩沖液配方?
A:不需要。S-Trap 兼容 SDS、尿素、NP-40、RIPA、SDT 等多種裂解緩沖液,研究人員可延續原有的樣品裂解習慣,無需重新建立裂解流程。
Q10:上海起發實驗試劑有限公司能提供哪些服務?
A:作為 ProtiFi 特約代理經銷商,上海起發實驗試劑有限公司可提供 ProtiFi 品牌產品的銷售、技術支持與售后服務,協助用戶完成產品選型、訂購及使用咨詢。
關鍵詞:ProtiFi,ProtiFi上海代理,ProtiFi中國代理,ProtiFi北京代理,ProtiFi江蘇代理, ProtiFi廣東代理,K02-micro-10, C02-micro-80, C02-micro-10, C02-micro-40,ProtiFi、ProtiFi 特約代理、上海起發實驗試劑有限公司、S-Trap、S-Trap Micro Kit、S-Trap 96-well Micro Plates、S-Trap Turbo、Si-Trap、Tryp-N、ProtiFi 樣品制備、蛋白質組學樣品制備、多組學樣品制備、組學樣品制備試劑盒、S-Trap 使用方法、Tryp-N 蛋白酶、ProtiFi 產品介紹、ProtiFi 代理經銷、ProtiFi 品牌、ProtiFi 組學技術、ProtiFi SimpliFi 數據平臺
更多產品信息,請聯系中國區域代理商:上海起發實驗試劑有限公司
(注:本文內容基于品牌公開資料及行業常規信息整理,具體以品牌信息文檔為準。)
??ProtiFi熱賣產品
貨號 | 品名 | 規格 |
C02-micro-40 | S-Trap micro columns (≤ 100 μg) | 40pk |
C02-mini-10 | S-Trap™ mini columns (100 - 300 μg) | 10PACK |
K02-micro-10 | S-Trap™ micro kit (10x ≤ 100 μg) | 10pack |
C02-micro-80 | S-Trap™ micro columns (≤ 100 μg) | 80 Pack |
C02-micro-10 | S-Trap™ micro columns (≤ 100 μg) | 10 pack |
K01-20 | Tryp-N™ Kit | 20ug |
C02-mini-80 | S-Trap™ mini columns (100 - 300 μg) | 80 Pack |
C02-midi-10 | S-Trap™ midi columns (≥ 300 μg) | 10pack |
C02-96well-1 | S-Trap™ plate (100 – 300 μg per well) | 1plate |
K02-mini-10 | S-Trap™ mini kit (10x 100 – 300 μg) | 10 pack |
C02-midi-20 | S-Trap™ midi columns (≥ 300 μg) | 20 Pack |
C002-MIDIX-0040PK | S-Trap™ Midi Spin Columns for proteomics samples (≤ 1 mg) | 40PK |
C02-mini-40 | S-Trap™ mini columns (100 - 300 μg) | 40Pack |
96-well S-Trap™ plate | 96-well S-Trap™ plate (100 – 300 μg per well) | 1 plate |
K02-96-1 | Universal proteomics sample preparation kit, 96 well plate (100 µg - 300 µg) with solutions | kit |
K02-micro-160 | S-Trap™ Micro Column sample prep kit format for samples ≤ 100 µg | 160 pack |
P002-96MCR-0001PL | S-Trap™ 96-well Micro Plate | 1plate |
P002-96MNI-0010PL | S-Trap™ 96-well Mini Plate for proteomics samples (100 – 300 µg) | 10plates |
S-Trap™ midi columns | S-Trap™ midi columns (≥ 300 μg) | 10Pack |
K01-10 | Tryp-N™ Kit | 10ug |
CO2-mini-10 | S-Trap™ mini columns (100-300μg) | 10Pack |
C02-Mmidi-10 | S-Trap™ midi columns (≥ 300 μg) | 10pack |
C02-midi-40 | S-Trap™ midi columns (≥ 300 μg) | 40Pack |
C02-96well-3 | 96-well S-Trap™ plate (100 – 300 μg per well) | 3plates |
C02-96-well-3 | S-Trap™ 96-well Mini Plate | 3-Pack |
C002MICRO0080PK | S-Trap™ Micro Spin Columns for proteomics samples (1 – 100 µg) | 80PK |
C002-MIDIX-0020PK | S-Trap™ Midi Spin Columns for proteomics samples (≤ 1 mg) | 20PK |
C002-MIDIX-0010PK | S-Trap™ Midi Spin Columns for proteomics samples (≤ 1 mg) | 10PK |
K02-mini-160 | S-Trap™ Mini Column sample kit format for samples from 100 µg - 300 µg. | 80 Pack |
P002-96MCR-0010PL | S-Trap™ 96-well Micro Plate for proteomics samples (1-100ug) | 10plates |
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